Nghiên cứu một số đặc điểm vùng gen mã hóa Protein của chủng Porcine Parvovirus gây bệnh Khô thai ở lợn nuôi tại Việt Nam

Nguyễn Văn Giáp, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Đặng Hữu Anh, Nguyễn Thành Trung, Vũ Thị Ngọc, Cao Thị Bích Phượng, Lê Huỳnh Thanh Phương.

        Bệnh khô thai do porcine parvovirus (PPV) gây ra là một trong những bệnh rối loạn sinh sản ở lợn luôn được người chăn nuôi quan tâm. Mặc dù bệnh này đã xuất hiện ở Việt Nam từ lâu, nhưng cho tới nay có tương đối ít nghiên cứu về bệnh và lưu hành của virus này. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm góp phần làm rõ đặc điểm sinh học phân tử cơ bản của chủng virus phân lập PPV.DN.001. Trong 4.752 nucleotide được giải mã, chủng PPV.DN.001 mang đặc điểm của nhóm parvovirus; có khả năng tái bản độc lập với tỷ lệ %GC là 37,2%; không có vùng giàu CpG. Chủng virus mã hóa 4 protein phi cấu trúc và 2 protein cấu trúc với cách sắp xếp mang đặc điểm của virus thuộc giống protoparvovirus. Capsid protein VP1 của chủng PPV.DN.001 mang đầy đủ các vùng chức năng điển hình của PPV. Trong 6 nhóm di truyền của PPV, chủng PPV.DN.001 thuộc nhóm C và sai khác với chủng PPV nhược độc (NADL2) ở 7 vị trí trên capsid protein.

Sơ đồ vị trí và trình tự amino acid các vùng chức năng thuộc protein VP1

        Ghi chú: từ vị trí 1- 150 là trình tự riêng của VP1, vùng dấu chấm màu đỏ là trình tự chung của VP1 và VP2 (VP1/VP2). Đánh dấu màu xám là trình tự đặc trưng motif phospholipase A2, với x biểu thị amino acid bất kỳ. Gạch chân màu đỏ và hình bầu dục đỏ là các trình tự vận chuyển protein vào nhân tế bào. Vùng quyết định kháng nguyên được ký hiệu 1-9 và giới hạn bởi mũi tên 2 đầu.

Tham khảo: Tạp chí KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXXI SỐ 5 – 2024