Huỳnh Thị Mỹ Lệ & cs
Bộ môn Vi sinh vật – Truyền nhiễm
Porcine circovirus type 2 (PCV2) là tác nhân truyền nhiễm quan trọng ở lợn, gây ra nhóm bệnh liên quan đến PCV2 (PCVAD). Nghiên cứu này nhằm xác định tỷ lệ lưu hành và đặc điểm di truyền của PCV2 tại các trang trại chăn nuôi lợn ở Việt Nam.
Kết quả phân tích bộ gen, protein capsid và phát sinh chủng loài cho thấy toàn bộ 30 chủng PCV2 phân lập tại Việt Nam đều thuộc kiểu gen PCV2b, được phân bố trong các cụm di truyền 1A, 1B, 1C và các dạng tái tổ hợp. Bộ gen của các chủng virus có chiều dài 1767 nucleotide và có mức tương đồng trình tự nucleotide dao động từ 96,0% đến 100%. Các thay thế axit amin trong protein capsid của các chủng PCV2 Việt Nam chủ yếu tập trung tại các vùng ưu thế miễn dịch (immunodominant regions). Đáng chú ý, phần lớn các chủng (24/30) biểu hiện sự kéo dài lysine tại đầu C của protein capsid. Phân tích phát sinh địa lý theo phương pháp Bayesian cho thấy tồn tại các mối liên hệ dịch tễ giữa các cụm PCV2 tái tổ hợp trong phạm vi nội địa cũng như giữa các quốc gia, qua đó gợi ý sự lưu hành của các dạng PCV2 tái tổ hợp. Phân tích bổ sung dựa trên chỉ số kháng nguyên Jameson–Wolf antigenic index cho thấy sự biến đổi kháng nguyên tại các vị trí quan trọng của protein capsid (vị trí 131–133) giữa cụm tái tổ hợp và các cụm PCV2b khác.
Link bài báo: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23414511/
English