Phân tích hệ gen của Duck Circovirus ở vịt nuôi tại tỉnh Quảng Ninh năm 2024

Đồng Văn Hiếu,  Hoàng Công Thành, Vũ Thị Thu Trà, Nguyễn Thị Hoàng Yến, Bùi Trần Anh Đào và Trần Thị Hương Giang
Khoa Thú y, Học viện Nông nghiệp Việt Nam

Tính cấp thiết: Ở Việt Nam, DuCV đã được báo cáo vị ở Hà Nội và Bắc Giang (Nguyen và ctv, 2020; Dong và ctv, 2022). Kết quả bước đầu cho thấy, tỷ lệ đồng nhiễm hai loại virus theo trại và theo cá thể lần lượt là 36,36% và 18,75% (Dong và cs., 2022). Thống kê tỷ lệ nhiễm DuCV ở vịt nuôi tại 6 tỉnh, thành phố miền Bắc cho thấy, tỷ lệ vịt dương tính với virus ở mức tương đối cao chiếm 43,08% theo cá thể và 68,42% theo trang trại (Tran và cs., 2022). Trong đó, tỷ lệ dương tính cao nhất tập trung ở vịt từ 3-4 tuần tuổi. Kết quả phân tích trình tự gen cho thấy, các chủng DuCV xác định được năm 2021 thuộc genotype I và II (Tran và cs., 2022). Như vậy, DuCV đã và đang gây ra những hậu quả nhất định đối với ngành chăn nuôi vịt ở nước ta hiện nay, nghiên cứu về biến đổi di truyền của virus là cần thiết cung cấp thông tin quan trọng trong hoạch định chiến lược phát triển các phương pháp chẩn đoán nhanh, hiệu quả và phát triển vaccine phòng bệnh.

Mục đích nghiên cứu: Nghiên cứu này nhằm giải mã trình tự hệ gen của DuCV ở vịt nuôi tại tỉnh Quảng Ninh năm 2024.

Phương pháp nghiên cứu: Tổng cộng 5 mẫu gộp gồm não, tim, gan, lách, phổi được thu thập từ vịt 3 tuần tuổi ở trang trại vịt trên địa tỉnh Quảng Ninh. Phương pháp khuếch đại gene (polymerase chain reaction – PCR) đã được sử dụng để chẩn đoán DuCV trong mẫu bệnh phẩm. Mẫu dương tính được giải trình tự gen bằng phương pháp Sanger tại công ty 1^st BASE, Malaysia.

Kết quả chính: Hệ gene của chủng virus Vietnam/VNUA-416/2024 có kích thước 1.994bp. Tỷ lệ tương đồng nucleotide giữ chủng DuCV trong nghiên cứu này với các chủng virus ở Việt Nam dao động 83,24-99,04% và có quan hệ di truyền gần với các chủng virus ở Trung Quốc.

Kết luận: Nghiên cứu này đã xác định được DuCV trong 3 con vịt nuôi tại một trang trại vịt tại Thị xã Quảng Yên, Tỉnh Quảng Ninh vào tháng 6/2024. Chủng DuCV Vietnam/VNUA-416/2024 có trình tự hệ gen dài 1.994 nucleotide thuộc genotype I, subgenotype Ic và có mối quan hệ di truyền gần với chủng virus báo cáo ở Trung Quốc..

Từ khóa: DuCV, PCR, Việt Nam, Vịt.

Link bài báo: Tạp chí KHKT Chăn nuôi số 308: 64-68.